Die Forschung der Philosophischen Fakultät erstreckt sich auf die Bereiche Kulturgeschichte, Kulturwissenschaft, Digitalität, Sprachwissenschaft und Bildung, mit einer besonderen Expertise und Forschungsstärke zu den Kulturen des Ostseeraums und der Romantik.

Die Kulturen des Ostseeraums werden u.a. in vier größeren Verbundprojekten (FragTrans, Herrenhauszentrum, Grenzregime, Saints and Heroes) und einem internationalen Graduiertenkolleg (Baltic Peripeties) erforscht. Gebündelt werden diese Forschungen im universitätsweiten Interdisziplinären Forschungszentrum Ostseeraum (IFZO). Zum Schwerpunkt Romantik gehört die Organisation wissenschaftlicher und öffentlicher Veranstaltungen wie der Jahrestagung der Friedrich Schlegel-Gesellschaft 2023 und im Rahmen des Caspar David Friedrich-Jubiläums 2024 in Greifswald.

Die Philosophische Fakultät ist maßgeblich am universitären Forschungsschwerpunkt „Kulturen des Ostseeraums“ sowie an den Profilbereichen „Kultur und Praxis des digitalen Handelns“  und „Think rural!“ beteiligt.